Comment les biobanques révolutionnent la recherche médicale – et pourquoi le Canada en a besoin pour la maladie de Lyme
La maladie de Lyme est un problème en évolution rapide au Canada qui ne disparaîtra pas comme ça, avertit un expert de CanLyme.
Nous avons tous entendu parler des grandes avancées dans la détection précoce des maladies et le ciblage de traitements précisément adaptés au profil génétique des patients – en fait, plusieurs de ces nouvelles techniques ont peut-être déjà sauvé la vie de nos amis et proches – et même la nôtre.
Mais ce qui est beaucoup moins connu, c’est un phénomène croissant qui contribue à faire des percées en recherche biomédicale. On appelle cela la biobanque – la collecte de grandes quantités d’échantillons comme du sang, des tissus, de la moelle osseuse, de l’urine et de l’ADN, ainsi que la collecte des données associées aux patients. Des chercheurs de nombreuses institutions peuvent ensuite utiliser ces ressources pour aider à trouver de nouvelles méthodes de dépistage, traitements, traitements et moyens de prévenir un large éventail de maladies.
Il y a des milliers de biobanques à travers le monde. Certaines sont de petites collections d’échantillons et de données, tandis que d’autres sont massives, comme la UK Biobank, décrite sur son site web comme « le jeu de données le plus complet et le plus largement utilisé de son genre ».
Certains des travaux les plus intrigants associés aux biobanques ont lieu ici même, dans ce pays. « C’est incroyable et tellement excitant de voir ce qui se passe partout, et cela se passe ici même dans les universités à travers le Canada », déclare le Dr John McLaughlin, professeur émérite d’épidémiologie à la Dalla Lana School of Public Health de l’Université de Toronto et ancien directeur scientifique de Santé publique Ontario.
McLaughlin, qui siège au Conseil consultatif de la Fondation canadienne de la maladie de Lyme, a joué un rôle clé il y a 25 ans dans la création de la plus grande biobanque du Canada, le Partenariat canadien pour la santé de demain, aussi connu sous le nom de CanPath, qui a recueilli des échantillons et des données provenant de plus de 330 000 Canadiens jusqu’à présent.
CanPath et ses biobanques similaires permettent des recherches « jamais possibles auparavant au Canada parce que le type de données approprié n’existait pas », explique McLaughlin, qui a récemment pris sa retraite en tant que directeur de CanPath.
« J’adore absolument voir des jeunes – certains sont des étudiants diplômés ou des stagiaires dans divers instituts de recherche – capables de faire un travail qui était auparavant impossible, même pour leurs professeurs », ajoute-t-il.
« Ils génèrent activement de nouvelles découvertes qui sont immédiatement innovantes et excitantes. »
Découvertes motivées par les biobanques
McLaughlin souligne plusieurs avancées que les données de CanPath ont contribué à générer, notamment un travail dirigé par la Dre Jennifer Brooks visant à améliorer le dépistage du cancer du sein.
Il cite aussi des biomarqueurs découverts dans des échantillons sanguins prélevés de nombreuses années avant la maladie d’une personne, comme le cancer, dans une étude menée par le Dr Nick Cheng, récemment diplômé en doctorat, sous la supervision du Dr Philip Awadalla, ainsi que des travaux révolutionnaires sur les effets de la qualité de l’air sur la santé, notamment sur l’arthrite, dirigés par le Dr Sasha Bernatsky et le Dr Trevor Dummer.
Aux États-Unis, il existe de nombreux exemples de biobanques, dont une dédiée à la maladie de Lyme. Basée dans la région de la baie de San Francisco, elle comprend huit sites à travers le pays. Ses échantillons et données sont accessibles aux chercheurs hors des États-Unis, y compris aux Canadiens.
Mais McLaughlin croit que les chercheurs canadiens sur la maladie de Lyme bénéficieraient de collaborer pour établir une biobanque qui rend les données et biospécimens de partout au pays accessibles aux scientifiques d’institutions à travers le pays.
« (La maladie de Lyme) est une situation en évolution rapide au Canada, elle ne va pas disparaître, et il y a un besoin urgent de preuves solides qui répondent aux besoins des Canadiens », dit-il.
Comment une biobanque canadienne de la maladie de Lyme pourrait stimuler la recherche
La maladie de Lyme est la maladie vectorielle la plus courante au Canada. Elle est causée par des bactéries transportées par des tiques qui transmettent les agents pathogènes lorsqu’elles mordent d’autres animaux et des humains. Les changements climatiques ont aidé ces tiques à se multiplier et à augmenter leur aire de répartition dans diverses régions du Canada, notamment dans les Maritimes et les régions du sud de l’Ontario, du Québec, du Manitoba et de la Colombie-Britannique.
Selon l’Agence de la santé publique du Canada, les provinces et territoires ont signalé plus de 27 000 cas de maladie de Lyme entre 2009 et 2024. Mais une
De plus, comme la maladie de Lyme est relativement nouvelle pour les Canadiens et que ses symptômes ressemblent à ceux d’autres maladies, il est très difficile pour les médecins de diagnostiquer, comme le rapporte un article du Dr Robert Schoen. Souvent, ils le détectent trop tard, laissant certains patients avec des symptômes chroniques invalidants, incapables de travailler et leur qualité de vie réduite. Dans de rares cas, cela peut même mener à la mort.
« Il y a tellement de questions qui nécessitent des preuves plus claires … et il y a de grands besoins pour plus et de meilleures recherches », dit McLaughlin.
Il affirme qu’une biobanque dédiée à la maladie de Lyme devrait « atteindre une taille suffisamment grande pour qu’il y ait suffisamment de participants, et suffisamment de données de haute qualité pour être informative et répondre à des questions scientifiques importantes. »
Cela, dit-il, nécessiterait une grande variété d’échantillons – tissus, sang, urine, etc. – ainsi que des informations sur les patients et leur environnement, quand et où ils ont eu une piqûre de tique, le type de tiques porteuses de maladies avec lesquelles ils ont été en contact, ainsi que le moment de l’infection diagnostiquée.
L’élément du temps est un « changement de jeu »
Une biobanque nécessiterait des données recueillies sur des années, puis ultimement des décennies, afin que les chercheurs puissent suivre l’infection, comment elle progresse, comment elle se propage dans le corps au fil du temps et quels sont ses effets à long terme, non seulement sur des patients individuels, mais aussi sur des populations plus larges.
« Intégrer cet élément de temps dans la conception des biobanques change la donne », dit-il.
« Disposer d’une biobanque qui se maintient dans le temps et permet à la science d’examiner les effets liés au temps est crucial » pour trouver les réponses dont les chercheurs ont besoin, ajoute-t-il.
« Les tiques changent, la personne change, son environnement change et nous savons que si vous détectiez un effet biologique, cela dépendra du moment où cet échantillon de sang ou d’urine … a été enlevé. »
Un tel ensemble de données pourrait éventuellement mener à la découverte de nouvelles façons de détecter la maladie de Lyme et les bactéries qui la causent, afin que les cliniciens puissent la diagnostiquer plus tôt, appliquer des traitements plus efficaces et des stratégies préventives, ainsi que de nouvelles façons de contrôler les symptômes chroniques chez les personnes souffrant de la maladie de Lyme longue, dit-il.
Mais un projet aussi à long terme nécessite un investissement soutenu, une expertise de premier ordre et une technologie de pointe pour continuer de croître sur la longue période nécessaire afin de recueillir suffisamment de données pour générer des résultats, avertit McLaughlin.
« Il faut un engagement large et des équipes capables d’attirer des financements. Une fois le succès démontré, davantage de chercheurs, d’équipes et de financements seront attirés », dit-il.
La présidente de CanLyme, Dre Janet Sperling, affirme que la fondation travaille à établir une biobanque qui fait tout ce que McLaughlin décrit.
« CanLyme a longtemps plaidé pour une biobanque afin de fournir des données concrètes sur les controverses apparemment insolubles entourant la maladie de Lyme », explique Sperling.
« Nous savons que les scientifiques disposent des outils nécessaires, et que les patients et leurs familles sont prêts à fournir les données et les échantillons de tissus. Notre objectif est de faire partie d’un mouvement qui rend cela possible et qui favorise des recherches importantes et révolutionnaires. »
L’éthique est une partie essentielle de la biobanque
Un autre aspect important d’une biobanque efficace est un code d’éthique qui protège les données des patients et garantit que leurs informations ne tombent pas entre de mauvaises mains.
« Un consentement pleinement éclairé est essentiel en biobanque », dit McLaughlin, lorsqu’il s’agit d’inciter les patients à donner leurs échantillons ainsi que leurs informations et données personnelles.
« Le consentement concerne le fait d’être clair sur le but, pourquoi nous faisons quelque chose, comment l’information ou les biospécimens seront utilisés, et qui aura l’autorité d’utiliser ces informations », ajoute-t-il.
McLaughlin affirme que l’éthique est l’un des piliers fondamentaux sur lesquels repose CanPath. L’éthique comporte de nombreuses dimensions, qui incluent pour la biobanque :
- Ne pas faire de mal.
- Informer les participants des risques et bénéfices potentiels.
- Protéger la vie privée et assurer la confidentialité.
- S’assurer que les patients ne soient pas forcés de donner leurs échantillons et informations.
- Les informer qui utilisera le matériel et qui bénéficiera de toute découverte tirée de leurs données.
- L’équité, la diversité et le mérite scientifique dans la recherche qui utilise la biobanque.
- Accessibilité de la recherche à toutes les communautés.
- Transparence sur la recherche et ses résultats.
McLaughlin affirme que les codes éthiques concernant la recherche biomédicale ont évolué pendant près d’un siècle et qu’ils se sont adaptés au cours des dernières décennies, à mesure que la pratique de la biobanque a pris de l’ampleur.
« Maintenant, nous avons des lignes directrices éthiques beaucoup plus claires et plus strictes … à laquelle tous les chercheurs des universités canadiennes et des institutions de recherche en santé accréditées doivent se conformer », dit-il.
« Ces normes canadiennes de conduite éthique s’appliquent dans toutes les régions du pays et garantissent que les biobanques et leur utilisation en recherche en santé respectent les meilleures pratiques éthiques. »